按照《关于贯彻落实企业所得税法若干税收问题的通知》(国税函[2010]79号，下称79号文件)规定，企业转让股权收入，应于转让协议生效、且完成股权变更手续时，确认收入的实现。
笔者认为，现行税法对股权转让所得确认的相关规定有待完善。
比如，A公司欲将手中持有的D公司1200万元的股权以1000万元转让给B公司，双方于2009年3月1日签署协议转让D公司股权，并商定在5月1日前B公司将股权转让款1000万元支付给A公司。
A公司随后配合D公司修改股东名册并到工商管理部门办理股权变更登记手续，B公司按照合同约定于4月20日将股权款1000万元汇到A公司账户。
但是，股权变更手续迟迟未办，直到2010年的3月1日才在工商部门办理完毕。按照税法的规定，A企业股权转让所得为-200万元，并应确认在2010年。
先看对股权转让所得额度确认的规定。我国《公司法》第七十二条规定有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权，但是《公司法》及相关法律除了对国有股权的转让价格作了硬性规定(为了防止国有资产流失，国有股权转让的价格则必须不得低于每股的净资产价值)外，对于其他的普通股权转让价格尚未作明确的规定。
实务中，对于普通股权转让的价格确定有四种方式：第一种方式，股权转让价款由转让方与受让方协商确定，可称为“协商价法”;第二种方式，股权转让价款按公司工商注册登记的出资额确定，可称为“出资额法”;第三种方法，股权转让价款按公司的净资产额确定，可称为“净资产法”;第四种方式，股权转让价款按照公司资产审计评估后的价格确定，可称为“评估价法”。
上例中A公司与B公司转让股权是通过协商确定，转让价格明显低于投资价格。但按规定，只有当双方为关联企业时，税务机关才可以适用《企业所得税法》中的特别纳税调整条款。
而非关联企业时，目前尚无具体法规对该项业务进行规范。
再看对股权转让纳税义务发生时间的确认。根据《合同法》第四十四条规定，股权转让合同自成立时生效。但股权转让合同的生效并不等同于股权转让生效。
《物权法》第二十三条规定，动产物权的设立和转让，自交付时发生效力，但法律另有规定的除外。实践中，股权转让协议往往是附生效条件的合同，双方当事人签章后合同成立，但尚未生效，待履行董事会决议、股东会决议，涉及国有资产的还包括国资部门的认可，涉及上市公司的还包括证监会的确认等等，若条件满足，转让协议生效。
现有法律并无股权转让合同必须在办理登记手续后才能生效的规定，因此登记不是合同生效的要件。股权转让合同生效后，转让方的主要义务是向受让方移交股权，为防止日后出现股权转让纠纷，股权转让合同一般会对权属变更和权能转移作出明确约定。
当事人凭协议和相关文书在办理股权变更登记后，股权转让实现。
国家税务总局为了便于税收征管，在79号文件中明确了股权转让所得纳税义务发生时间是转让股权生效，且完成股权变更手续时。
可以这样认为，股权转让所得的实现，税法更看重股权登记，即使股权转让合同已经签订，只要股权变更手续没有变更，企业当年也不确认股权转让所得。
《国家税务总局关于广西中金矿业有限公司转让股权企业所得税收入确认问题的批复》(国税函[2010]150号)也是按照上述内容进行答复的。
但此规定给了企业一个筹划空间。还以上例为例，假如A公司当年转让价款为1500万元，其他条件不变，则该企业股权所得为300万元并应确认在2010年。
如果企业2009年和2010年均盈利，那么该企业可以获取该部分所得形成税款的货币时间价值;而如果企业2009年盈利，2010年生产经营出现亏损，那么该企业可以用此部分所得弥补亏损，获取股权转让所得不缴企业所得税的利益。
通过分析可以发现，在股权转让过程中，一是对非关联企业股权转让价款偏低情况目前尚无调整的法律规定，建议国家税务总局及时出台政策对偏低股权转让价进行纳税特别调整。
二是确认股权转让纳税义务发生时间的规定不够严谨，容易造成税款流失，建议借鉴《公司法》和《公司登记管理条例》的相关规定，要求转让股权自协议生效后之日起30日内必须办理股权变更手续，否则自满30日之日起确定股权转让纳税义务发生时间。
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一、股权转让个人所得税完税证明怎样办理决定股权变更后，先前往当地地税部门递交申请进行税源监控，一周左右去税务部门领取税源监控意见表后前往工商部门进行变更登记即可。股权转让个人所得税完税证明流程有以下几点：1、领取《公司变更登记申请表》(工商局办证大厅窗口领取);2、变更营业执照(填写公司变更表格，加盖公章，整理公司章程修正案、股东会决议、股权转让协议、公司营业执照正副本原件到工商局办证大厅办理);
1、召开公司股东大会，研究股权出售和收购股权的可能性，分析出售和收购股权的目的是否符合公司的战略发展，并对收购方的经济实力经营能力进行分析，严格按照公司法的规定程序进行操作。 2、聘请律师进行律师尽职调查。 3、出让方和受让方双方进行实质性的协商和谈判。 4、出让方(国有、集体)企业向上级主管部门提出股权转让申请，并经上级主管部门批准。 5、评估、验资(私营有限公司也可以协商确定股权转让价格)。
一、股权转让不需要交税的情况是：股权以平价或低价转让的，不缴纳个人所得税。还要一种情况也不用交税，比如当事人是通过继承、遗产处分，或者是直系亲属之间无偿的赠予股权，一般这种情况下，对双方当事人也是不征收个人所得税的。
